2024/9/23 8:25:00

按照无内毒素质粒小提中量试剂盒进行质粒小量提取:

1.柱平衡步骤:向吸附柱CP4中(吸附柱放入收集管中)加入500μl的平衡液BL,12,000rpm(~13,400×g)离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。(请使用当天处理过的柱子)。

 

2.取5-15ml过夜培养的菌液加入离心管中,12,000rpm(~13,400×g)离心1min,尽量吸除上清。

注意:菌液较多时可以通过几次离心将菌体沉淀收集到一个离心管中。收集的菌体量以能够充分裂解为佳,菌体过多裂解不充分会降低质粒的提取效率。

 

3.向留有菌体沉淀的离心管中加入500μl溶液P1(请先检查是否已加入RNaseA),使用移液器或涡旋振荡器彻底悬浮细菌细胞沉淀。

注意:请务必彻底悬浮细菌沉淀,如果有未彻底混匀的菌块,会影响裂解,导致提取量和纯度偏低。

 

4.向离心管中加入500μl溶液P2,温和地上下翻转6-8次使菌体充分裂解。

注意:温和地混合,不要剧烈震荡,以免污染基因组DNA。此时菌液应变得清亮粘稠,所用时间不应超过5min,以免质粒受到破坏。如果未变得清亮,可能由于菌体过多,裂解不彻底,应减少菌体量。

 

5.向离心管中加入500μl溶液P4,立即温和地上下翻转6-8次,充分混匀,此时会出现白色絮状沉淀,然后室温放置10min左右,12,000rpm(~13,400×g)离心10min,此时在离心管底部形成沉淀。

注意:P4加入后应立即混合,避免产生局部沉淀。如果上清中还有微小白色沉淀,可再次离心后取上清。

 

6.将上一步收集的上清液分次加入过滤柱CS(过滤柱放入收集管中),12,000rpm(~13,400×g)离心2min,滤液收集在干净的2ml离心管中(自备)。

 

7.向滤液中加入0.3倍滤液体积的异丙醇(加入异丙醇过多容易导致RNA污染),上下颠倒混匀后转移到吸附柱CP4中(吸附柱放入收集管中)。

注意:过滤后滤液会损失,根据损失的不同请加入不同体积的异丙醇。吸附柱CP4的最大容积为700μl,所以需要分次过柱。

 

8.室温12,000rpm(~13,400×g)离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。

注意:将第7步中所得溶液分次过柱,每次均按以上条件操作。

 

9.向吸附柱CP4中加入500μl去蛋白液PD,12,000rpm(~13,400×g)离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP4放入收集管中。

 

10.向吸附柱CP4中加入600μl漂洗液PW(请先检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm(~13,400×g)离心1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP4放入收集管中。

注意:加入漂洗液PW后,如果室温静置2-5min,有助于更好地去除杂质。

 

11.向吸附柱CP4中加入600μl漂洗液PW,12,000rpm(~13,400×g)离心1min,倒掉收集管中的废液。

 

12.将吸附柱CP4重新放回收集管中,12,000rpm(~13,400×g)离心2min,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除。

注意:漂洗液中乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。为确保下游实验不受残留乙醇的影响,建议将吸附柱CP4开盖,置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。

 

13.将吸附柱CP4置于一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加

100-300μl洗脱缓冲液TB,室温放置2min,12,000rpm(~13,400×g)离心1min将质粒溶液收集到离心管中。

注意:为了增加质粒的回收效率,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,重复步骤12。洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液,应保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率。洗脱缓冲液体积不应少于100μl,体积过小影响回收效率。且DNA产物应保存在-20℃,以防DNA降解。

 

质粒DNA浓度及纯度检测

得到的质粒DNA可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。

电泳可能为单一条带,也可能为2到3条DNA条带,这主要与提取物培养时间长短、提取时操作剧烈程度等有关。

OD260值为1相当于大约50μg/ml双链DNA。

OD260/OD280比值应为1.7–1.9,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用去离子水,比值会偏低,但并不表示纯度低,因为pH值和离子存在会影响光吸收值。

 

 

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