一、什么是细胞STR鉴定？

细胞STR鉴定（Short Tandem Repeat，短串联重复序列鉴定）是一种通过检测细胞DNA中特定STR位点的多态性，来确认细胞身份和检测交叉污染的方法。STR位点由长度为3至7个碱基对的短串联重复序列组成，这些序列在个体间具有高度多态性，类似于细胞的“DNA指纹”。

二、细胞STR鉴定的原理是什么？

细胞STR鉴定的原理基于STR位点的多态性。每一株构建的细胞系都有一组特异性的STR数据与之对应。通过PCR（聚合酶链式反应）扩增细胞DNA中的STR位点，然后使用毛细管电泳分离扩增产物，并通过荧光检测识别不同的等位基因。最后，将检测到的STR分型结果与专业的细胞STR数据库进行比对，从而确认细胞系身份或检测交叉污染。

三、细胞STR鉴定有哪些应用场景？

细胞STR鉴定在生物医学研究领域有广泛的应用，包括但不限于以下场景：

1.发表文章或申请课题经费前：确保所使用的细胞系身份正确，避免研究结论因细胞系错误而受到影响。

2.使用细胞进行临床治疗（试验）前：确保治疗或试验使用的细胞系纯净无污染，保障患者的安全。

3.准备冻存保种或已冻存多年的细胞：在冻存前或复苏后鉴定细胞系身份，防止交叉污染。

4.细胞试验项目开始/结束时：确认项目开始和结束时细胞系的身份，确保实验数据的准确性。

5.新得到的细胞或实验室培养多代的细胞：对新获得的细胞或培养多代的细胞进行鉴定，确认其身份和纯度。

6.细胞系表现不稳定或结果与预期差别较大时：通过STR鉴定检测细胞系是否发生交叉污染或遗传变异。

四、如何进行细胞STR鉴定？

细胞STR鉴定的流程通常包括以下几个步骤：

1.样品准备：从待验证的细胞样本中提取DNA，或使用已提取的基因组DNA。

2.PCR扩增：使用具有特异性的引物对STR位点进行PCR扩增。

3.电泳分离：将PCR扩增产物进行电泳分离，形成不同的条带。

4.荧光检测与数据分析：使用荧光检测器识别电泳图谱中的等位基因，并通过软件分析得到STR分型结果。

5.结果比对：将检测到的STR分型结果与专业的细胞STR数据库进行比对，确认细胞系身份或检测交叉污染。

五、如何根据STR数据判断细胞系的身份？

通过将细胞系鉴定结果和STR信息与参考数据库进行比对，判断细胞样本与各参考细胞的匹配度。一般认为，匹配度≥80%可认为细胞系正确；匹配度在50%~79%之间时，建议结合细胞系形态、细胞系特异性标记物等辅助分析进行综合判断；匹配度<50%则判定受检细胞样本与其对应的标准细胞系不相关。

六、STR鉴定报告中的“无法匹配任何已知数据”是什么意思？

如果STR鉴定报告结论为“无法匹配任何已知数据”，说明送检的细胞系标准序列未被收录在国际细胞库中，导致送检样本与任何序列都不匹配。这可能是因为该细胞系是自主构建的新细胞系，或者其标准序列尚未被收录到数据库中。在这种情况下，可以利用细胞的遗传信息建立自己的遗传特性，以便后期与自建的细胞库进行比对。

七、细胞STR鉴定能否检测交叉污染？

是的，细胞STR鉴定可以检测交叉污染。如果分型图谱显示，两个以上的STR基因座同时出现多等位基因的现象（即一个基因位点出现3个或以上峰），可判定细胞系存在交叉污染（特殊细胞系除外，如融合细胞系的标准STR数据就是多等位基因）。

八、细胞STR鉴定的注意事项有哪些？

1.样品准备：确保样品具有代表性，细胞数量足够（通常要求细胞数≥10^6个），并使用封口膜封好盖子，防止样品在运输过程中崩开。

2.检测时间：常规检测时间通常为2~3周，超常检测时间则在10个工作日之内。

3.结果解读：需要由专业人员进行结果解读和比对，确保鉴定结果的准确性。

4.应用限制：细胞STR鉴定结果仅用于基础科研，严禁用于司法鉴定及临床治疗等领域。

九、哪些细胞系可以进行STR鉴定？

目前，人源细胞系和小鼠细胞系的STR分型技术相对成熟，相关的数据库也比较完善，因此可以通过STR分型来确认细胞系身份。其他动物细胞系的STR分型技术现阶段还不成熟，目前无法进行STR鉴定，只能进行种属鉴定。

十、STR鉴定在细胞系管理中的重要性是什么？

STR鉴定在细胞系管理中具有至关重要的作用。通过定期鉴定细胞系身份和检测交叉污染，可以确保实验数据的准确性和可靠性，避免因细胞系错误或污染而导致的研究结论错误和结果不可重复。同时，STR鉴定也是保障临床细胞治疗安全性和有效性的重要手段之一。