2025/3/17 11:49:00

环介导等温扩增(Loop-Mediated Isothermal Amplification, LAMP)技术原理浅析

环介导等温扩增(LAMP)是一种由T. Notomi等人在2000年研发的新型核酸扩增技术。它能够在恒温条件下,通过链置换DNA聚合酶(如Bst DNA聚合酶)实现DNA片段的高效、快速扩增,从而广泛应用于基因检测领域。本文将详细解析LAMP技术的原理及其扩增过程。

 

一、LAMP技术的基本原理

LAMP技术的基本原理是利用4条或6条特异性引物,针对靶基因的6个特定区域进行设计,在链置换DNA聚合酶的作用下,于60-65℃的恒温条件下进行核酸扩增。这一温度范围是双链DNA复性及延伸的中间温度,使得DNA在此温度下处于动态平衡状态,便于链置换反应的发生。

 

二、LAMP技术的引物设计

LAMP技术的引物设计是其成功的关键。通常需要设计4条引物,包括两条内引物(FIP和BIP)和两条外引物(F3和B3)。在某些情况下,还可以设计额外的环引物(Loop F和Loop B)以提高扩增效率。

1.正向内引物(FIP):由F2和F1c区域组成,F2区域与靶基因3’端的F2c区域互补,F1c区域与靶基因5’端的F1c区域序列相同。

2.正向外引物(F3):由F3区域组成,与靶基因的F3c区域互补。

3.反向内引物(BIP):由B1c和B2区域组成,B2区域与靶基因3’端的B2c区域互补,B1c区域与靶基因5’端的B1c区域序列相同。

4.反向外引物(B3):由B3区域组成,与靶基因的B3c区域互补。

引物设计的复杂性使得LAMP技术具有很高的特异性,任何一个区域的引物不匹配都会导致扩增失败。

 

三、LAMP技术的扩增过程

LAMP技术的扩增过程可以分为复制起始阶段和循环扩增阶段。

1.复制起始阶段:

正向内引物FIP的3’端F2序列与靶DNA的F2c区域结合,引导DNA合成。

正向外引物F3比FIP短,缓慢地与模板中的F3c互补配对,并启动链置换DNA合成,置换出正向内引物FIP引导的合成链。被置换出的DNA单链(片段A)由于5’端含有F1c和F1序列,可互补配对形成茎环结构。

置换出来的单链DNA的3’端B2c区域可与反向内引物BIP的B2序列结合引导DNA合成。然后反向外引物B3与3’端B3c互补配对,并置换出反向内引物BIP合成的DNA单链。最终被置换出来的DNA单链5’端和3’端均含有可自身互补配对成环的序列(B1c/B1和F1c/F1),形成茎环结构(片段B)。

2.循环扩增阶段:

片段B的3’端形成环状结构后,可以以自身序列为模板引导DNA链合成。同时,3’端环状部分的F2c区域为单链状态,可与正向内引物FIP的F2序列结合引导DNA合成。

新合成的DNA单链3’端含有B1/B1c序列,可再次互补配对成环,并且3’端又可以自身序列为模板引导DNA链合成,同时置换出前面合成的DNA链。

如此往复循环,形成一系列交替反向重复靶序列构成的不同个数茎环结构、多环花椰菜样结构的DNA片段混合物。

 

四、LAMP技术的优势与应用

LAMP技术相比传统PCR技术具有诸多优势,包括操作简便、反应快速、特异性强、灵敏度高、设备要求低、结果易于检测等。这些优势使得LAMP技术在病原微生物检测、传染性疾病诊断、环境监测、食品安全等领域得到了广泛应用。

1.操作简便:LAMP反应不需要复杂的温度循环控制,只需一个简单的恒温装置即可完成反应。

2.反应快速:LAMP反应可在15-60分钟内实现10^9~10^10倍的核酸扩增。

3.特异性强:LAMP技术使用多条引物,对靶基因具有高度选择性,减少了非靶标序列的影响。

4.灵敏度高:LAMP技术能够检测到极低浓度的靶基因。

5.设备要求低:LAMP反应不需要昂贵的PCR仪,只需一个简单的恒温装置即可。

6.结果易于检测:LAMP反应产物可通过电泳、浊度法或染料法进行检测,其中染料法最为常用,可实现实时检测。

 

五、结论

LAMP技术作为一种新型的核酸扩增技术,以其操作简便、反应快速、特异性强、灵敏度高、设备要求低、结果易于检测等优势,在基因检测领域展现出了广阔的应用前景。随着技术的不断发展和完善,LAMP技术将在更多领域发挥重要作用。

 

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