一、核心方法原理与适用场景
1. 紫外分光光度法(UV Spectrophotometry)
原理:利用核酸在260nm处的紫外吸收特性(碱基共轭双键),结合朗伯-比尔定律(A=εcb)计算浓度。
仪器代表:NanoDrop(1-2μL样品,2-3分钟出结果)。
优点:操作简单,无需染料或标准品。
局限:
灵敏度有限(dsDNA检测下限2ng/μL)。
无法区分DNA/RNA,受游离核苷酸、蛋白质干扰。
适用场景:常规核酸浓度检测(如PCR产物分析、质粒提取评估)。
2. 荧光光度法(Fluorometry)
原理:特异性荧光染料(如SYBR Green、PicoGreen)与核酸结合后发射荧光,强度与核酸量成正比。
仪器代表:Qubit(5分钟出结果)。
优点:灵敏度高(pg级),可区分DNA/RNA。
局限:需标准曲线,染料成本高。
适用场景:微量核酸定量(如基因表达分析、病毒载量监测)。
3. 实时荧光定量PCR(qPCR)
原理:通过Ct值与起始模板浓度的对数反比关系定量,需标准曲线。
仪器代表:ABI 7500、Roche LightCycler。
优点:特异性高,灵敏度达fg级。
局限:操作复杂,依赖引物/探针设计。
适用场景:低浓度核酸、基因表达分析、病原体检测。
4. 数字PCR(dPCR)
原理:将反应体系分割为微滴,统计荧光信号阳性微滴数,通过泊松分布计算浓度。
仪器代表:Bio-Rad QX200。
优点:绝对定量,抗干扰性强。
局限:成本高,需预实验确定浓度范围。
适用场景:稀有突变检测、拷贝数变异分析。
5. 定磷法/定糖法(传统比色法)
原理:
定磷法:核酸磷含量与钼蓝化合物吸光度成正比。
定糖法:戊糖脱水生成醛类化合物,与成色剂反应显色。
优点:成本低,操作简便。
局限:准确性低,易受杂质干扰。
适用场景:粗略估计核酸含量(如教学实验)。
二、方法选择决策树
1.优先紫外分光光度法:
样品浓度>0.25ng/μL,需快速检测且不要求区分DNA/RNA。
2.选择荧光光度法:
微量核酸(pg级),需区分DNA/RNA或避免杂质干扰。
3.采用qPCR/dPCR:
低浓度核酸(fg级),需高灵敏度或特异性检测(如病原体、稀有突变)。
4.慎用传统比色法:
仅用于科研初步筛选或教学演示。
三、最新技术进展与趋势
1.灵敏度革命:
核酸检测试剂最低检出限达100拷贝/mL,总体检出率>95%。
2.速度突破:
传统方法需4小时,现缩短至1小时(最快30分钟)。
3.自动化升级:
一体化检测设备实现“样品进-结果出”,减少人为误差。
4.多场景覆盖:
便携式产品(现场检测)、多病毒联检试剂(呼吸道病毒6联检)。
5.技术融合:
纳米孔测序:实时分析核酸浓度与序列(如Oxford Nanopore)。
微流控芯片:集成核酸提取、扩增与检测,提升通量。
四、关键质量控制点
1.纯度评估:
A260/A280比值(DNA≈1.8,RNA≈2.0)初步判断蛋白质污染。
A260/A230比值<2.0提示盐类或有机物残留。
2.标准曲线验证:
qPCR/荧光法中,R²>0.99确保定量准确性。
3.重复实验:
至少3次独立实验,计算CV值(<5%为优)。
五、未来方向
1.单分子检测:结合纳米技术实现单分子核酸计数。
2.AI辅助分析:深度学习模型预测核酸浓度,降低人为误差。
3.临床转化:开发即时检测(POCT)设备,适配基层医疗。
通过合理选择方法、严格质量控制及技术更新,可实现核酸浓度的精准定量,为分子生物学研究提供可靠数据支持。