2025/3/26 14:10:00

类器官 RNA 提取方法(以超纯总 RNA 快速提取试剂盒为例)

一、试剂准备

超纯总 RNA 快速提取试剂盒(含 DNase I),货号 abs60026。

其他所需试剂和器材,如氯仿、异丙醇、75%乙醇、无 RNase 的水或 0.5%SDS(溶液均需用 DEPC 处理过的水配制)、无酶枪头、无酶 EP 管、加样枪、EP 管架、水浴锅、高速低温离心机等。

 

二、类器官收集及洗涤

1.类器官收集:移液器吸去培养基,每孔添加 1~2mL 左右 4℃类器官传代培养缓冲液(abs9730),轻柔吹打基质胶,收集在 15mL 离心管中(24 孔板,每 5 孔为一组),4℃静置 10min 或-20℃放置 5min(目的是使基质胶软化),300g,4℃,离心 5min 弃上清。

2.类器官清洗:添加 1mL 类器官传代培养缓冲液重悬,转移到 1.5mL EP 管,300g,4℃,离心 5min 弃上清。

 

三、RNA 提取步骤

1.细胞裂解:向含类器官沉淀的 EP 管中加入 1mL 的 RL(试剂盒组分)溶解细胞,并用移液枪轻轻吹打混匀,使 RL 充分和类器官接触裂解细胞并灭活 RNA 酶。

2.核蛋白体分解:将匀浆样品剧烈震荡混匀,在 15~30℃条件下孵育 5min 以使核蛋白体完全分解。

3.氯仿萃取:每 1mL RL 加 0.2mL 氯仿。盖紧样品管盖,剧烈振荡 15sec 并将其在室温下孵育 3min。

4.离心分层:于 4℃,12000rpm 离心 10min,样品会分成三层:下层有机相,中间层和上层无色的水相,RNA 存在于水相中。水相层的容量大约为所加 RL 体积的 60%,把水相转移到新管中,进行下一步操作。

5.沉淀 RNA:加入 1 倍体积 70%乙醇(请先检查是否已加入无水乙醇!),颠倒混匀(此时可能会出现沉淀)。得到的溶液和可能沉淀一起转入吸附柱 RA 中(吸附柱套在收集管内)。

6.洗涤:

12000rpm 离心 45sec,弃废液,将吸附柱重新套回收集管。

加 400μL 去蛋白液 RE,12000rpm 离心 45sec,弃废液。

向吸附柱 RA 中央加入 80μL DNase I 工作液(取 10μL DNase I 储存液放入新的 RNase-free 离心管中,加入 70μL RDD 溶液,轻柔混匀配制而成),室温放置 15min(一般情况下室温放置可得到较好的消化效果,如果室温效果不佳可选择在 37℃放置 15min)。

加 400μL 去蛋白液 RE,12000rpm 离心 45sec,弃掉废液。

加入 500μL 漂洗液 RW(请先检查是否已加入无水乙醇!),12000rpm 离心 45sec,弃掉废液。

再次加入 500μL 漂洗液 RW,12000rpm 离心 45sec,弃掉废液。

7.干燥与洗脱:将吸附柱 RA 放回空收集管中,12000rpm 离心 2min,尽量除去漂洗液,以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应。取出吸附柱 RA,放入一个 RNase free 离心管中,根据预期 RNA 产量往吸附膜的中间部位加 50~80μL RNase free H2O(事先在 65℃水浴中加热效果更好),室温放置 2min,12000rpm 离心 1min,所得溶液即为 RNA 溶液。如果需要较多 RNA,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,离心 1min。

 

四、RNA 保存与应用

提取得到的 RNA 溶液,可以直接应用于 Northern 杂交、RT-PCR、Real Time RT-PCR、cDNA 文库构建、体外翻译等各种常规分子生物学实验。

 

类器官蛋白提取方法(以细胞浆、细胞核及细胞膜蛋白抽提试剂盒为例)

一、试剂准备

细胞浆、细胞核及细胞膜蛋白抽提试剂盒(abs9346)。

其他所需试剂和器材,如磷酸酶抑制剂 II、蛋白酶抑制剂 PMSF、移液器、离心机等。

 

二、溶液准备

室温融解试剂盒中的各种溶液,溶解后除结构蛋白提取液外,其他试剂立即置于冰上。

结构蛋白提取液溶解后,可放置于 37℃水浴中温浴至透明后,常温放置。

 

三、蛋白提取工作液准备

1.胞浆蛋白提取工作液:临用前,根据处理样品的量估算实验时胞浆蛋白提取液的需要量,并分别按照 1:50 比例加入磷酸酶抑制剂 II 和 1:100 比例加入蛋白酶抑制剂 PMSF。

2.胞核蛋白提取工作液:临用前,根据处理样品的量估算实验时胞核蛋白提取液的需要量,并分别按照 1:50 比例加入磷酸酶抑制剂 II 和 1:100 比例加入蛋白酶抑制剂 PMSF。

3.膜蛋白提取工作液:临用前,根据处理样品的量估算实验时膜蛋白提取液的需要量,并分别按照 1:50 比例加入磷酸酶抑制剂 II 和 1:100 比例加入蛋白酶抑制剂 PMSF。

4.结构蛋白提取工作液:临用前,根据处理样品的量估算实验时结构蛋白提取液的需要量,并分别按照 1:50 比例加入磷酸酶抑制剂 II 和 1:100 比例加入蛋白酶抑制剂 PMSF。

 

四、类器官收集及洗涤

1.类器官收集:移液器吸去培养基,每孔添加 1~2mL 左右 4℃类器官传代培养缓冲液(abs9730),轻柔吹打基质胶,收集在 15mL 离心管中(24 孔板,每 5 孔为一组),4℃静置 10min 或-20℃放置 5min(目的是使基质胶软化),300g,4℃,离心 5min 弃上清。

2.类器官清洗:添加 1mL 类器官传代培养缓冲液重悬,300g,4℃,离心 5min 弃上清。

 

五、蛋白提取步骤

1.胞浆蛋白提取:

向含类器官沉淀的 EP 管中加入 2mL 的胞浆蛋白提取工作液,在 4℃条件下震荡 20min。

准备 1~5mL 的注射器,用注射器吹打步骤 1 震荡过的溶液 50~90 次,在 4℃条件下,15000g 离心 10min。取上清液存于 EP 管中,即为胞浆蛋白。

胞核蛋白提取:取胞浆蛋白提取后获得的沉淀物加入 4mL 冰浴的胞浆蛋白提取工作液,在 4℃条件下震荡 5min,4℃条件下 15000g 离心 10min,弃去上清液,沉淀物中加入 1mL 冰冻的胞核蛋白提取工作液,在 4℃条件下震荡 5min,4℃条件下 15000g 离心 10min,上清液为细胞核蛋白,转入 EP 管并保存。

2.胞膜蛋白提取:在胞核蛋白提取后的沉淀物中加入 1mL 冰冻的膜蛋白提取工作液,在 4℃条件下震荡 5min,4℃条件下 15000g 离心 10min,上清液为细胞膜蛋白,转入 EP 管并保存。

3.结构蛋白提取:在胞膜蛋白提取后的沉淀物中加入常温或 37℃水浴过的透明的结构蛋白提取工作液 0.5mL,4℃条件下震荡 5min,4℃条件下 15000g 离心 10min,保存上清液即为细胞骨架蛋白。

 

六、蛋白保存与应用

待检测浓度的蛋白存于-70℃,可以用于 Western、EMSA、footprinting、报告基因检测以及酶活力测定等后续操作。

 

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