质粒DNA的提取
质粒DNA的提取方法有很多种,从提取产量上分可分为微量提取、中量提取、大量提取,从使用仪器上分可分为一般提取和试剂盒方法提取,从具体操作方法分可以分为碱裂解法、煮沸法、牙签法等。
以下是碱裂解法提取质粒DNA的基本步骤:
1.培养细菌:将含有质粒的细菌(如大肠杆菌)接种到LB液体培养基中,37℃振荡培养过夜(12~16小时)。
2.收集菌体:取适量菌液加入离心管,离心后弃上清,留下菌体沉淀。
3.重悬菌体:加入溶液I(含葡萄糖和EDTA),震荡混匀,使菌体悬浮起来。
4.裂解细胞:加入溶液II(NaOH和SDS),轻轻颠倒混匀,使细胞壁裂解,质粒DNA释放。
5.中和与沉淀:迅速加入预冷的溶液III(含乙酸钾),中和NaOH并沉淀蛋白质和细胞碎片。
6.离心分离:高速离心后,质粒DNA在上清中,细胞碎片和蛋白质在管底。
7.纯化质粒:通过吸附、洗涤等步骤去除杂质,最终得到纯净的质粒DNA。
质粒DNA的电泳鉴定
电泳鉴定是评估质粒DNA分子量和纯度的重要方法。
以下是电泳鉴定的基本步骤:
1.制备凝胶:通常使用0.7%~1.2%的琼脂糖凝胶,加入电泳缓冲液后倒入电泳槽中,待其凝固后拔出梳子,形成加样孔。
2.加样:将待测的质粒DNA样本与上样缓冲液混合后,加入加样孔中。同时准备DNA分子量标准品(DNA Marker),用于估算未知DNA的大小。
3.电泳:连接电泳仪,设置适当的电压和时间进行电泳。在电泳过程中,DNA片段会根据其大小和电荷在凝胶中迁移,形成不同的条带。
4.观察与拍照:电泳结束后,取出凝胶,使用紫外线灯或凝胶成像系统观察DNA条带。比较待测样本DNA条带与DNA Marker中条带的位置,估算质粒DNA的大小。同时,观察条带的清晰度和锐利度,评估质粒DNA的纯度。
注意事项
1.实验准备:穿上实验服,戴上手套和口罩,保持台面整洁,无菌操作是关键。
2.操作轻柔:在提取和电泳过程中,操作要轻柔,避免DNA断裂或降解。
3.溶液现配现用:某些溶液(如溶液II)需要现配现用,避免失效。
4.防止污染:确保所有溶液和工具无RNase污染,保护RNA完整性。
5.电泳条件:根据凝胶浓度和所需分辨率设定适当的电压和时间,确保电泳效果。